MagMeDIP-seq Package V2
MeDIP-seq library prep. kit for low DNA amount
네이처 논문에 인용된 gDNA 추출에서 라이브러리 준비까지 모든 시약을 포함한 패키지
NGS 분석에 대해 검증된 올인원 MeDIP-seq 키트
낮은 DNA 요구량: 반응당 최저 10ng
강력한 분석법, 우수한 농축 및 사용하기 쉬운 프로토콜
반복 실험 간의 높은 재현성
모든 종에 적합
그림 1. MagMeDIP-seq 패키지 V2를 사용하여 생성된 CpG shore에서 메틸화 감지 NGS 데이터
MeDIP-seq 라이브러리는 Diagenode의 MagMeDIP-seq 패키지 V2를 사용하여 인간 혈액 샘플에서 유래한 50ng의 게놈 DNA에서 준비하였습니다. IP 및 해당 INPUT 샘플은 Illumina NovaSeq 기기에서 paired-end 50bp로 시퀀싱되었습니다. 전체 게놈 DNA 메틸화 프로필을 생성하기 위해 read mapping. 위의 이미지는 CpG island 자체가 아닌 CpG shore에서 감지되는 DNA 메틸화의 두 가지 예를 보여줍니다. 이 데이터는 CpG 섬에 인접한 이러한 영역에서 메틸화 부위의 많은 부분이 발생한다는 최근 발견과 일치합니다.
그림 2. Diagenode MagMeDIP-seq 패키지를 이용한 인간 혈액 샘플과 대조군 영역에 대한 coverage profiles
(A) 음성 대조군 영역에서 메틸화가 불검출. 이미지는 GAPDH 유전자의 TSS (Transcription Start Site) 주변 영역을 나타내며, 예측과 같이 이 영역에서 피크가 나타나지 않음.
(B) 양성 대조군 영역에서 검출 된 높은 메틸화. 이미지는 HIST1H2BA (TSH2b) 유전자와 그 주변을 나타냄. HIST1H2BA 유전자는 혈액 세포에서 발생하지 않는 히스톤 변이를 코딩하고 있으며 메틸화에 의해 침묵하는 것으로 알려짐. 이 유전자 근처에서 높은 커버리지 관찰.
Contents
- MagMeDIP qPCR Kit (x10)
- iDeal DNA IP library preparation kit (x24)
- iDeal UDI modules (x24)
- IPure kit v2 (x24)
Quick glance
| KITS | ||
| MagMeDIP qPCR | MagMeDIP-seq Package | |
| Resolution | 100-500bp | 100-500bp |
| Downstream application | qPCR, NGS | NGS |
| Initial fragment size (bp) | 100-600 (200) | 200 |
| Input DNA (ng) | 100-1000 | 100-1000 |
| Turnaround time | 2-3 days | 4 |
| All buffers | V | V |
| Controls | V | V |
| All library prep reagents | Separately in iDeal Library prep (C05010020) | V |
| Indexes | 24 included (C05010025) | |
| Purification | V | V |
| Beads for IP | V | V |
| Automated Kits | C02010013 (10 rxns) C02010014 (48 rxns) |
n/a |
| Manual Kits | C02010020 (10 rxns) C02010021 (48 rxns) |
C02010041 (10 rxns) |