Tagmentase (Tn5 transposase)
Diagenode 사의 Tagmentase – loaded는 Illumina 호환 시퀀싱 어댑터가 미리 로드 된 hyperactive Tn5 transposase입니다.
- Tagmentase (Tn5 transposase) – loaded 10ul (Cat. C01070012-10)
- Tagmentase (Tn5 transposase) – loaded 30ul (Cat. C01070012-30)
Tagmentation은 효소가 여러 단계를 거치지 않고, 한 번에 DNA를 절단하고, DNA 단편의 끝에 시퀀싱 어댑터를 연결하는 반응으로, Tagmentase는 빠르고 간편하게 Tagmentation-based library 제작을 도와드립니다.
Flexibility
– 원하는 DNA 올리고로 Tagmentase를 조립
– 모든 tagmentation 기반 라이브러리 준비에 사용 가능 –ChIPmentation, ATAC-seq, RNA-seq, BS-seq ……
빠른 속도
– ligation-based protocols에 비해 더 빠른 라이브러리 제작 속도
Tagmentase(Tn5 transposase) – loaded는 ChIPmentation, ATAC-seq와 같은 tagmentation 기반 라이브러리 준비를 사용하는 모든 응용 실험에 사용할 수 있습니다.
Tagmentase loaded와 unloaded 차이는 무엇인가요?
Tagmentase loaded 제품은 Illumina 호환 시퀀싱 어댑터가 미리 로드되어 있습니다. Tagmentase unloaded 제품은 DNA oligo가 미리 로드되어 있지 않아, 다양한 목적으로 적용 가능합니다.
Figure 1. Tagmentase 사용 후, 람다 DNA의 효율적인 단편화
Figure 2. Tagmentase 양에 따른 Fragmentation 효율
응용 프로그램에 따라 다른 Tagmentase 농도가 필요. Tagmentase Dilution Buffer는 트랜스포솜 조립 전후에 Tagmentase를 희석하는 것을 권장.
Figure 3. Tagmentase로 생성된 ATAC-seq 라이브러리의 일반적인 라이브러리 프로파일
ATAC-seq는 Tagmentase(Tn5 transposase) – loading(Cat. No. C01070012) 및 Tagmentation Buffer(2x)(Cat. No. C01019043)를 사용하여 K562 세포의 50,000개 핵에서 수행되었으며, Fragment Analyzer를 이용하여 라이브러리 프로파일 생성.
| Cat. | Product name | Format |
| C01070010-10 | Tagmentase (Tn5 transposase) – unloaded | 10ul |
| C01070010-20 | Tagmentase (Tn5 transposase) – unloaded | 20ul |
| C01070010-500 | Tagmentase (Tn5 transposase) – unloaded | 500ul |
| C01070010-1000 | Tagmentase (Tn5 transposase) – unloaded | 1000ul |
| C01070012-10 | Tagmentase (Tn5 transposase) – loaded | 10ul |
| C01070012-30 | Tagmentase (Tn5 transposase) – loaded | 30ul |