Bioruptor Pico

DNA/RNA/Chromatin Shearing을 위한 모델

보증 기간 5년
150 ~ 1,000 bp size의 fragment 획득 가능
동시에 6 ~ 16개 샘플을 한 번에 처리 (튜브 별 상이)
20 uL ~ 2 mL의 용량 처리 처리 가능 (튜브 별 상이)
온도 조절 장치 기본 장착으로 시료의 일정한 온도 유지 가능
작동시 발생하는 소음 방지를 위한 방폐 상자 불필요
초음파가 샘플에 간접적으로 전달되어 샘플 변성 방지 (ACT, Adaptive Cavitation Technique)
높은 재현성과 빠른 속도
모든 플랫폼에 사용 가능한 프로토콜 제공
경제적인 소모품 비용
다수의 논문에 수록되어 연구자들로부터 인정받은 성능

PRODUCT	BIORUPTOR® PICO
DESCRIPTION	Best suited for ChIP-seq and NGS
KEY APPLICATIONS	sample preparation
	Chromatin shearing 200 bp – 1kb
	DNA shearing 150 bp – 1 kb
	RNA shearing 200 bp – 1 kb
	FFPE nucleic acid extraction
	Cell lysis and tissue disruption
	Mass spectrometry
	Protein aggregations
THROUGHPUT	16 samples (for 0.2 ml tube holder)
	12 samples (for 0.65 ml tube holder)
	6 samples (for 1.5 ml tube holder)
	6 samples (for 15 ml tube holder)
RECOMMENDED VOLUMES	20 – 100 μl (0.2 ml Bioruptor tubes)
	100 μl (0.65 ml Bioruptor tubes)
	100 – 300 μl (1.5 ml Bioruptor tubes)
	300 μl – 2 ml (15 ml Bioruptor tubes)
TEMPERATURE CONTROLLED	√

Bioruptor의 특수공진방식

Accessories

DNA/RNA shearing
Chromatin shearing
Cell and tissue disruption
FFPE DNA extraction
Next generation sequencing
Other biological applications: mitochondria disruption, cell dissociation, plat cell transformation
Other chemical and pharmaceutical applications: emulsification, homogenization etc.

Application notes

DNA Shearing-bioruptor pico [다운로드]

LC-MS measurement of whole-body uptake of pharmaceuticals in zebrafish using the Bioruptor® Plus for sample preparation [다운로드]

Spatial tissue proteomics of FFPE specimen using the Bioruptor® for sample preparation [다운로드]

DNA shearing

최적의 NGS 라이브러리 준비에서 가장 중요한 요소 중 하나는 시퀀싱 할 DNA의 품질입니다. 신뢰할 수 있는 NGS 결과를 얻으려면 먼저 DNA가 적절한 사이즈로(sequencing platform에 따라 다름)로 일관성있게 shearing되어야 합니다. Bioruptor는 NGS workflow에 필수적인 우수한 수율, 크기 및 일관성을 제공합니다.

RNA shearing

RNA Sequencing은 알려지지 않은 transcriptome에 대한 정보를 얻을 수 있는 아주 정확하고 민감도 높은 method입니다. 최상의 cDNA synthesis과 sequencing을 위해서는 reverse transcription 전에 RNA가 적절한 크기로 단편화되어야합니다. Bioruptor는 편향적이지 않은 RNA shearing 을 제공하며 고품질 NGS 결과를 보장합니다.

Protein extraction

생화학 실험에서는 조직이나 포유류, 효모 및 박테리아 세포에서 단백질을 추출해야하는 경우가 많습니다. 고품질의 단백질을 높은 수율로 얻는 것은 PAGE, Western blot, 질량 분석 또는 단백질 정제와 같은 downstream protein characterization에 중요합니다. Bioruptor를 이용하면, 초음파 처리 기반으로 세포를 파쇄하게 됩니다. 이 방식은 한 번에 조직 및 배양 세포를 효율적으로 파쇄하고 균질화할 수 있어 식별 가능한 펩티드 및 단백질 수를 크게 향상시킵니다.

Protein seeding and aggregations

Amyloid-like aggregates (amyloid fibrils)의 형성은 정상적인 proteome의 기능을 방해하고 신경 퇴행성 질환의 독성에 기여합니다. Amyloid 형성 및 세포 증식 특성 연구에서, 초음파 처리는 새로운 응집체 성장을 위한 아밀로이드 섬유 분해에 쓰입니다. 이 때 아밀로이드 섬유가 분해되면서 응집체 형성이 촉진 되고, seed가 준비되게 됩니다. Bioruptor는 초음파 처리 및 온도 처리를 통해 seeding material을 표준화하고 생성하는 데 많은 이점이 있습니다.

Applications	Bioruptor® Pico	Bioruptor® Plus
NGS DNA shearing	Excellent	Good
Chromatin shearing	Excellent	Excellent
NGS RNA shearing	Excellent	Good
DNA extraction from FFPE	Excellent	Excellent
Cell and tissue disruption for protein extraction (for mass spectrometry or other applications)	Excellent	Excellent
Cell and tissue disruption for RNA extraction	Less suitable	Excellent
Bacterial cell lysis	Good	Excellent
Compound solubilization	Good	Excellent
Liposome size reduction	Good	Excellent
Protein aggregation	Excellent	Excellent

Technical specification
Temperature control	Excellent	Excellent
Low noise level	Excellent	Good
Small footprint	Excellent	Good
Fast processing*	Excellent	Good
Shearing volume	20 µl -2 ml	50 µl -20 ml
Throughput	Up to 16 samples per run	Up to 12 samples per run